深圳市妇幼保健院成立于1979年，目前已发展成为集医疗、保健、教学、科研、预防为一体，以诊治妇产儿科常见病、多发病和疑难病症为重点的国内知名三级甲等妇幼保健院，是南方医科大学非直属附属医院以及多所高等院校的教学医院和实习基地。
医院一院两址，分别为红荔院区和福强院区，占地面积3.5万平方米，建筑面积15万平方米，编制床位1300张。年门急诊量183万余人次，住院病人5.3万余人次，分娩量2万余例。截至2021年7月，共有职工2146人，其中正高146人，副高310人，博士74人，硕士464人，博士生导师5人，硕士生导师36人。目前拥有地方级领军人才4人，“孔雀计划”C类人才3人，临床型实用人才2人，后备级人才3人。
医院设有产科、妇科、新生儿科、儿科（含儿外科）、生殖医学中心、生殖免疫综合科、中医科、针灸推拿科、乳腺科、口腔病防治中心、急诊科、麻醉科、医学遗传中心、检验科、病理科、放射科、超声科、药剂科、产前诊断中心、妇女保健科、儿童保健科、新生儿疾病筛查中心、儿童听力诊断中心、宫内疾病诊疗中心、聚焦超声无创治疗中心、儿童神经康复中心、宫颈癌早诊早治中心、乳腺癌防治中心等30多个医疗、医技、保健科室。第三代试管婴儿技术（胚胎植入前遗传学筛查技术，PGT）顺利通过国家现场评审，获得正式运行资质。
目前全市已建立以深圳市妇幼保健院为龙头，各区妇幼保健院为支撑，由市、区妇幼保健院、综合医院、社康中心组成的两级三层妇幼保健网络，保障全市各项妇幼指标持续向好，全市孕产妇死亡率、围产儿死亡率远低于全国平均水平，全市妇女儿童健康水平稳居全国前列。
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